Детство, проведенное в приморском городке Ареньс-де-Маре предполагало дальнейшее вступление в Королевскую морскую школу Арениса, но еще мальчиком Сеск влюбился в футбол и не хотел слышать ни о чем, кроме футбольной школы - школы "Барселоны". Его мать, вспоминая о детстве сына говорит: «всегда с мячом, он всегда был с мячом». Сеск Фабрегас стал болельщиком «Барселоны» с того самого момента, как впервые увидел её великолепную игру. С тех пор ни о каком морском училище и речи быть не могло – маленький Сеск вполне осознанно направился в футбольную школу «Барселоны», одну из лучших футбольных школ Испании. Этот период Сеск вспоминает, как лучшие годы своей жизни. И это несмотря на то, что ему приходилось прямиком из школы отправляться на тренировку, чтобы вернуться домой к одиннадцати вечера и засесть за уроки. Окрепший в «барселонской» кузнице талантов Сеск провёл некоторое время в пригородном клубе «Матаро», после чего оказался непосредственно во второй команде каталонского гиганта. Неудивительно, что «барселонский» молодняк очень скоро стал лучшим в Испании. Великолепное трио юных мастеров заставляло эту команду буквально парить над полем, поражая болельщиков и соперников непредсказуемостью и лёгкостью своего футбола. В защите играл Херард Пике, в атаке феерил Лео Месси, а в центре всем управлял не по годам разумный Сеск Фабрегас. Взрастив юную звезду, каталонский суперклуб не сумел его удержать. Многие обвиняют в этом Жоана Лапорту, но сам Фабрегас подобные суждения опровергает, уверяя, что переход в «Арсенал» в возрасте 16 лет был его самостоятельным решением.
В период выступлений за второй состав каталонцев он принял участие в молодежном чемпионате Европы-2003, где испанцы финишировали вторыми, а сам Фабрегас получил золотую бутсу, как лучший бомбардир, и золотой мяч как лучший игрок того первенства.

"Арсенал"

Летом 2003 года Фабрегас перешёл в академию «Арсенала». В обратном направлении в качестве компенсации последовали ван Бронкхорст и 700,000 фунтов.
В «Арсенале» Франсеск сразу же обновил несколько клубных рекордов: 23 октября 2003 года Сеск дебютировал за «Арсенал» в матче против «Ротерхэма» в основной команде в возрасте 16 лет 177 дней, став самым молодым игроком, выходившим в составе основной команды за всю историю. А вскоре он стал и самым моолдым автором гола в истории канониров, в матче кубка Лиги с «Вулверхэмптоном», выигранном со счётом 5-1, Сеск забил свой первый мяч в футболке «Арсенала».

Тем не менее, до начала сезона 2004–05 Фабрегас ни разу не выходил в первой команде за исключением матчей Кубка Лиги. Первым матчем была игра на СуперКубок с Манчестер Юнайтед. За этим последовало еще четыре успешных игры в Премьер Лиге: с Эвертоном, Миддлсбро, Блэкберном и Норвичем. Фабрегас сразу впечатлил многих, забив гол в ворота Блэкберна (победа Арсенала 3–0). А вскоре после этого он стал вторым по молодости игроком, забившим гол в Лиге Чемпионов (победа над Русенборгом 5-1).

В сезоне 2004-2005 его стали привлекать к играм в чемпионате. А в сезоне 2005-2006 Фабрегас, после ухода Виейра, Фабрегас стал регулярно выходить на поле в основном составе, сыграв 48 матчей в сезоне 2005/06. Многие сомневались в том, что он сможет сходу заиграть в топ-клубе английской премьер-лиги, но Сеск опроверг своей игрой эти сомнения. Еще ярче Фабрегас выступил в Лиге Чемпионов. Он провел отлчиную игру против мадридского «Реала» на «Сантьяго Бернабеу» в 1/8 финала (1-0 в пользу «Арсенала»), но ярче всего выступил в обоих четвертьфинальных матчах против «Ювентуса» (2-0 в Лондоне, 0-0 в Турине); в Лондоне он забил первый гол «Арсенала» и ассистировал Тьерри Анри во втором голевом моменте. Сеск помог «канонирам» и в этом лигочемпионском сезоне, в котором «Арсенал» стартовал 8 августа 2006 года, забив два мяча в ворота загребского «Динамо» (победа «Арсенала» 3-0).

Уровень игры Фабрегаса вызвал нешуточный интерес со стороны многих команд, в том числе и у него на родине. В частности мадридский Реал выразил готовность купить его за немалые деньги. Однако, 12 июля 2006 года, Арсен Венгер заявил, что испанец не продается. А 3 сенятбря 2006, предложил Фабрегасу новый контракт, который и был подписан 19 октября. Контракт позволит удержать игрока в клубе до его 27-летия.

2 декабря 2006 Сеск был удостоен премии Golden Boy, учережденной итальянским изданием TuttoSport, и основывающейся на голосовании ведущих журналистов Европы.

После конфликта Вильяма Галласа с Арсеном Венгером в 2008  Сеск получил капитанскую повязку, став одним из самых молодых капитанов в истории клуба.

«Барселона»

Испанские СМИ начали сообщать о его переходе в каталонский клуб, как только Сеск раскрылся в «Арсенале». Параллельно игроки «Барселоны» регулярно через СМИ призывали его присоединиться к ним. При каждом открытии трансферного окна в прессе появлялись слухи, что Сеск принял решение уйти и даже неофициально согласовал личный контракт, однако эти слухи тут же опровергались. Большой фурор вызвало заявление Сеска, сделанное в мае 2010 года. Он сказал, что не принимал решения покинуть «Арсенал», но играть за «Барселону» является мечтой, и, если он когда-нибудь покинет Лондон, то только ради каталонцев. Своё первое официальное предложение «Барселона» сделала летом 2010 года, несмотря на то, что незадолго до этого «Арсенал» заявил, что не будет вступать ни в какие переговоры по поводу продажи Фабрегаса. Предложение тут же было отклонено. Позднее «Барселона» незначительно увеличила предлагаемую сумму, однако это ничего не дало. Представители «Барселоны» открыто через прессу просили Сеска сделать всё, чтобы клуб продал его. Венгер всё это время неоднократно заявлял, что Сеск является ключевым игроком команды, поэтому продавать Фабрегаса он не планирует.

Летом 2011 ситуация достигла крайней точки. Сеск больше не опровергал желания присоединиться к каталонскому клубу уже сейчас.

Арсенал получил летом три конкретных предложения (Барса, Челси, МС) и одно туманное (Мадрид), причем, в финансовом плане предложение каталонцев являлось худшим из всех имеющихся вариантов. Но капитан Канониров дошел до прямого бойкота тренировок и турне, и его гипотетический следующий шаг тоже был известен – полузащитник официально попросил бы Арсенал выставить его на трансфер, а в таком требовании клуб не правомочен отказать. По сути, лондонская команда оказалась в безвыходном положении. Отказав Челси, Арсенал надеялся на Сити, который готовился выложить 50 миллионов евро, платить Сеску 12 миллионов в год, и отдать испанцу капитанскую повязку. Именно из-за Сеска переговоры между Канонирами и Сливочными так и не начались: агент центрокамписты категорически отверг даже саму вероятность появления полузащитника в стане злейшего соперника Барселоны.
Единственным покупателем осталась Барса, предлагавшая жалкие 29 миллионов евро сразу (при том, что даже на трансферном рынке Сеск стоил все 40), и еще 10 – в течение трех ближайших лет, в случае завоевания клубом определенных трофеев. Скрепя сердце, Арсен Венгер и Иван Газидис сказали: «Да».   

17 августа 2011 года дебютировал за «Барселону» в «класико» против «Реала» в рамках ответного матча за Суперкубок Испании 2011.

Трофеи Сеска не заставили себя долго ждать. В двух первых официальных матчах за Барселону он завоевал два титула. Столько же, сколько за 8 лет выступлений за Арсенал. 

22 августа 2011 года в рамках Кубка Жоана Гампера против «Наполи» Фабрегас на 25-й минуте забил первый гол за «Барселону».

26 августа 2011 года в Суперкубке Европы в матче с Порту забил второй гол. Матч завершился со счётом 2:0.

Первый гол в рамках чемпионата Испании забил в первом же матче с Вильярреалом, выйдя в стартовом составе.

Карьера в сборной Испании

15 мая 2006 Фабрегас был вызван в состав сборной Испании для участия в Чемпионате Мира 2006. 1 марта 2006 года Фабрегас сыграл свой первый матч за национальную сборную Испании, став самым молодым игроком, вызванным в основную команду за последние 80 лет. На самом ЧМ он выходил на замену во втором тайме в двух первых групповых матчах сборной, отметившись голевой передачей в матче с Тунисом. В третьем матче группового турнира он остался на скамейке запасных, но в матче 1/8 против Французов вышел в стартовом составе. Тот матч Испания проиграла 1–3.14 июня 2006 года Фабрегас стал самым молодым в истории испанского футбола игроком, принявшем участие в Чемпионате Мира. Когда он вышел на замену на 77 минуте матча с Украиной, ему было 19 лет и 41 дней.

На Евро-2008 в Австрии и Швейцарии Фабрегас, хотя и выходил в основном на замену, стал вторым игроком (после Иньесты), который сыграл все матчи на турнире! Испания без труда вышла в плей-офф, но никто пока не мог предугадывать победу, так вот первый четвертьфинальный матч Испании против Италии, основное время победителей не опредилило, а вот лотерея, тоесть пинальти (4:2), где Сеск, между-прочим забил, опредилила Испанию сильнее текущего чемпиона мира (Италии), в следуещем матче Испания встретилась с Россией (0:3), впрочем это их не первая встреча на ЕВРО 2008. Из-за травмы Давида Вильи Фабрегас вышел в основном составе сборной в финальном матче чемпионата и сыграл важную роль в победе над сборной Германии (1:0) - решающий гол забил Фернандо Торрес. Внимательно наблюдая за Сеском на поле, не трудно было установить его роль и тот вклад, который внес он в победу на ЕВРО 2008, уверенная игра в центре поля, нападающие всегда чуствовали опору сзади, что давало возможность для открытых действий.

Победитель чемпионата мира по футболу 2010. 11 июля 2010 года в финале чемпионата мира на 116-й минуте отдал голевой пас на Андреса Иньесту.